國家級重點實驗室

* 人工微結構與介觀物理
* 分子動態及穩定態結構
* 蛋白質工程及植物基因
* 生物膜與膜生物工程
* 視覺與聽覺信息處理
* 湍流與復雜系統研究
* 稀土材料化學及應用
* 區域光纖通信網與新型光通信系統
* 文字信息處理技術
* 環境模擬與污染控制
* 天然藥物及仿生藥物
* 微米/納米加工技術

教育部重點實驗室
* 數學與應用數學
* 重離子物理
* 生物有機與分子工程
* 量子信息與測量
* 納米器件物理與化學
* 地表過程分析與模擬
* 水沙科學
* 造山帶與地殼演化
* 神經科學
* 分子心血管
* 高分子化學與物理
* 流行病學
* 信息數學與信息行為

北京市重點實驗室
* 醫學物理和工程實驗室
* 空間信息集成與3S工程應用實驗室

衛生部重點實驗室
* 心血管分子生物學與調節肽衛生部開放實驗室
* 精神衛生學衛生部開放實驗室
* 腎臟疾病衛生部開放實驗室
* 神經科學衛生部開放實驗室
* 醫學免疫學衛生部開放實驗室
* 生育健康衛生部開放實驗室