學校有一批水平先進、設施完善的實驗室和科研基地。擁有“光電材料與技術”、“有害生物控制與資源利用”、“華南腫瘤學”、“眼科學”等4個國家重點實驗室，“水生經濟動物繁殖營養和病害控制”、“植物基因工程”等2個國家重點學科專業實驗室，“南海海洋生物技術”國家工程研究中心以及“國家新藥（抗腫瘤藥物）臨床試驗”研究中心等國家級科研機構；擁有“聚合物復合材料及功能材料”、“基因工程”、“生物無機與合成化學”、“數字家庭”、“眼科學”、“腫瘤相關基因與抗腫瘤藥物研究”、“熱帶病防治研究”、“干細胞與組織工程”等8個教育部重點實驗室；有馬克思主義哲學與中國現代化研究所、邏輯與認知研究所、港澳珠江三角洲研究中心、行政管理研究中心、歷史人類學研究中心、中國非物質文化遺產研究中心等6個教育部人文社會科學重點研究基地以及5個廣東省人文社會科學重點研究基地；并擁有眼科學實驗室、腎臟病臨床研究實驗室、輔助循環實驗室等3個衛生部重點實驗室以及11個廣東省重點實驗室。